In Nederland & Vlaanderen zijn de volgende zeven ziekenhuizen gespecialiseerd in GIST:

Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC)

Nederlands Kanker Instituut – Antoni van Leeuwenhoek Ziekenhuis, Amsterdam

Universitair Medisch Centrum Groningen (UMCG)

Radboudumc, Universitair Medisch Centrum Nijmegen

Erasmus Medisch Centrum – Daniel den Hoed Kliniek, Rotterdam